Известно с начала времен, что существует четыре кристалла стихий, которые управляют планетой, и вокруг этого крутится весь сюжет.
Прежде, чем вы получите над персонажем управление, вы просмотрите воспоминания темного рыцаря Сесила (Cecil), который является командиром эскадрильи под названием Красные Крылья (Red Wings), о том, как из города Мизидиа (Mysidia) он забрал стихийный Кристалл Воды, на что его подразделение отвечает сущим негодованием. Видимо, и сам капитан данным поступком не очень доволен и совершенно не понимает, с какой целью понадобились королю мировые кристаллы. Сесил, прилетев в замок Бэйрон (Baron), отдает королю кристалл, однако проявляет смелость и задает вопрос о причине захвата кристаллов планеты, за что король отстраняет его от звания капитана в эскадрилье Красных Крыльев. Охрана, выталкивая за двери Сесила, охрана наталкивается на лучшего друга Сесила, Драгуна Кайна (Kain Dragoon). Кайн приносит извинения за друга, и король двоих отправляет уничтожить некую деревню под названием Мист (Mist) и Сесилу дает кольцо (Bomb Ring). Тут впервые вы получаете над персонажем управление.