Kingdom Hearts - это история о мальчике по имени Сора. Он очень любит свои родные острова, но ему, все же, очень любопытно, что там - за их пределами… Впервые мы видим Сору в начальной заставке, когда он во сне падает в неизвестность.

Открыв глаза, он видит, что все еще на пляже. А вот и его лучший друг Рику - он старше Соры, и куда сдержаннее его. Рику протягивает руку вперед, но огромная волна накатывает на Сору и выносит его обратно на берег к Кайри - таинственной девочке, которая попала на остров к друзьям несколько лет назад. Кайри весело смеется, но вдруг ее лицо резко меняется. Обернувшись, сора видит себя самого, падающего с неба. Естественно, он в ужасе отступает назад, и, вдруг, проваливается под воду.

Чудесным образом, приземлившись на твердую поверхность, он оглядывается. Что это за странное место? Стая голубей взмывает ввысь, и под ногами он видит гравюру с изображением Белоснежки. Здесь он должен выбрать свои слабые и сильные стороны и научиться сражаться. Проваливаясь все ниже и ниже, он, наконец, вынужден вступить в схватку с гигантским черным чудовищем, которое победить ему не суждено. Чей-то голос шепчет ему, чтобы он не боялся, и что именно он откроет какую-то дверь. Сора еще сам об этом не знает, но в этот момент его судьба решена. Наконец-то он просыпается.

Над ним склоняется улыбающаяся Кайри, и он наконец понимает, что все это был лишь сон. Мы узнаем, что друзья решили построить плот, чтобы уплыть с острова и увидеть другие миры. После тяжелой работы, Сора Кайри и Рику, сидя на дереве, обсуждают предстоящее путешествие. Рику куда больше своих друзей озадачен тем, что выйдет из всей этой затеи. Очевидно, что им движут куда более серьезные цели, чем его друзьями, которые видят в этом лишь веселое приключение. В бореньях с собой, он не может решить, чего же ему хочется больше - покоя островной жизни, или неизведанности таинственных миров.

После беседы, Рику дает Соре Плод Паопу, добавив, что если двое людей разделят его между собой, их судьбы будут навечно связаны. Не приняв слова друга всерьез, Сора небрежно выбрасывает фрукт. На следующий день, Сора занимается поисками припасов для плота. Он заходит в секретную пещеру, а там загадочный человек в черной робе открывает ему все новые подробности его истинной судьбы. Не поняв толком ни слова, Сора забывает все, что слышал, лишь только покидает стены пещеры.

После того, как работа над плотом завершена, Сора и Рику устраивают забег, победитель которого сможет дать новому плоту имя. Затем, Рику повышает ставки, добавив, что победитель разделит с Кайри Плод Паопу, после чего Сора становится каким-то странно взволнованным. Видя это, Рику говорит, что это была всего лишь шутка, и Соре нечего дуться. Мы прекрасно видим, что Сора с Рику вечно соревнуются по любому поводу, вдобавок Рику сам утверждает, что он взрослее, а потому, многие интересные ему вещи скучны для Соры, но тот снова не принимает слова Рику всерьез, отмахиваясь от них.

В конце дня, Сора с Кайри, болтая ногами, сидят на причале и обсуждают предстоящее путешествие. Кайри вдруг заявляет, что Рику сильно изменился, и только ей с Сорой следует отправляться в путешествие. Что это? Ей очень нравится Сора? Или она недолюбливает Рику? А может и то и другое? Она спешит успокоить Сору, пораженного ее словами, и, рассмеявшись, заявляет, что она всего лишь шутила. А Сора, все еще под впечатлением, заявляет, что если уж кто и изменился, так это она…

Этой же ночью разражается ужасный шторм, из-за которого Сора просыпается среди ночи и бежит на соседний остров. Добравшись туда, он с ужасом видит существ из собственного сна, только теперь он абсолютно бессилен, ведь у него нет оружия. Сора бросается на Остров Паопу, где находит Рику. Все происходит прямо как в том же сне, Рику говорит, что этот мир связан, и протягивает Соре руку. Неужели он знает, что происходит? Сора не успевает дотянуться до руки Рику, и их обоих обволакивает Тьма. Секундой позже, Сора приходит в себя на том же месте, но Рику нигде нет. Рику выбрал Тьму, и она унесла его неизвестно куда… Сора же выбрал Свет, и странное оружие Ключ-клинок защитил его от Тьмы. Это причудливое оружие было даровано ему самим Светом. Размахивая им вокруг себя и отбиваясь от созданий Тьмы, он бежит к Секретной Пещере, и находит там Кайри. Дверь находящаяся там открывается, отбрасывая Кайри к Соре, но тот не может ее поймать, она пролетает сквозь него и исчезает. Поток ветра из двери вышвыривает Сору из Пещеры, и он видит того самого огромного монстра из сна. Только, на этот раз у него есть оружие, и он дает чудовищу отпор. Но перед тем как он успевает нанести сокрушающий удар, его вместе с монстром засасывает в водоворот в небесах.

Тем временем, в другом мире, Гуфи и Дональд находят письмо, оставленное Королем Микки. В нем он говорит, что звезды начали излучать странный свет, и Миры в опасности. Он просит их найти кого-то, кто владеет Ключом к выживанию. Пожелав напоследок, всего хорошего Мини и Дейзи, он так ничего толком и не рассказывает о том, куда и зачем он отправился. Итак, капитан королевской стражи, который не любит оружие, и придворный маг со вспыльчивой натурой, отправляются в путь - в Перекрестный Город, чтобы найти Леона, а уж там и Ключ, о котором говорил Король. Плуто увязывается вместе с ними.

Оказавшись в Перекрестном Городе, Гуфи и Дональд начинают поиски, а в это же самое время, на другом конце города, Сора падает сверху прямо на мостовую. Его, лежащего без сознания находят Юффи и Леон. Оказывается, что их самих, однажды, точно так же выбросило в этот мир. Они относят Сору в отель, и, когда он приходит в себя, он, сперва принимает Юффи за Кайри, и мы видим, как сильно он о ней волнуется. Юффи развеивает его сомнения, а Леон рассказывает Соре о Ключ-клинке.

Тем временем, Гуфи и Дональд встречают Айрис, которая тоже отводит их в отель и рассказывает все, что знает. Мы периодически видим то рассказ Айрис, то Леона и узнаем много нового. Мы узнаем, что существа, охотившиеся на Сору называются Бессердечными, и они нападали на него из-за того, что его сердце выбрано Ключ-клинком, которого они боятся как огня. Сора узнает о человеке по имени Энсем, который изучал Бессердечных, и писал о своих исследованиях подробные отчеты. Сора теперь - Мастер Ключ-клинка, и Бессердечные будут преследовать его везде. На вопрос, что же случилось с его родными островами, никто не может дать вразумительного ответа.

Теперь Сора герой в этом новом для него мире, и он следует за Леоном, уничтожая Бессердечных на своем пути. Когда он проходит под балконом, на него сверху сваливаются Гуфи с Дональдом, которые, заметив в его руках Ключ-клинок понимают - вот, что имел ввиду Король, говоря о Ключе! Они решают объединиться, и новоиспеченная команда восстанавливает некое подобие порядка в городе, избавившись от большинства Бессердечных. Дональд и Гуфи уговаривают Сору путешествовать вместе с ними по другим мирам на Корабле Мишек Гамми. Они уверяют его, что так у него будет гораздо больше шансов найти друзей, и хотя их аргументы вряд ли, могут кого-то убедить, Сора соглашается.

Мы видим, как злодеи из Диснеевских мультфильмов наблюдают за Сорой и его новыми друзьями. Они называют его «Носителем Ключ-клинка, который пытается победить Тьму». Похоже, что эта абстрактная Тьма, придает им сил… Мы возвращаемся в Перекрестный Город, и видим, что Сора с друзьями отбывают на Корабле Гамми навстречу новым мирам. В каждом из этих миров, Сора сражается с Бессердечными, и, с помощью Ключ-клинка, запирает Замочные Скважины. Делая это, он ограждает миры от новых нападок Бессердечных, которые пытаются их разрушить. Он также замечает, что девушек из всех посещенным им миров (например, Алису из Страны Чудес), кто-то похищает, и он понятия не имеет, кто и зачем.

В Колизее, Сора встречает Клауда из Final Fantasy VII. Аид пообещал ему, в обмен на помощь, встречу с тем, кого он ищет. [В оригинальной версии Клауд ищет "свой свет" и им была Айрис, в Final Mix издании он ищет "свою тьму" и это Сефирос]. Позже, мы снова видим Диснеевских злодеев, которые, как оказалось, замышляют план, связанный с Принцессами каждого из миров, именно за этим они и похищают их одну за другой.

Заперев две Замочные Скважины миров, друзья возвращаются обратно в Перекрестный Город, и там усовершенствуют корабль с помощью хитрого устройства под названием Навигамми. Теперь для них открыты новые миры. Сид, который как раз и колдует над кораблем, просит Сору отнести древнюю книгу волшебнику Мерлину. В пещере, Сора вдруг видит Кайри, но вскоре понимает, что она ему лишь померещилась. Ни с того ни с сего, появляется Рику, и Сора, конечно же, ужасно рад его видеть. Рику, однако ж, как ни странно, не разделяет его радости, и оказывается немало удивлен тому, что тот вообще жив, да еще и нашел себе новых друзей. У него самого в руках тоже меч неизвестного происхождения. Сора предлагает ему путешествовать вместе, но Дональд противится этому, а когда оба начинают спорить, Рику вдруг исчезает. Как ни странно, Сора не особенно расстраивается, и отправляется обратно к Леону и остальным.

Мы видим Рику и Злую Колдунью из сказки о Спящей Красавице. Колдунья указывает ему на беспечность Соры. Она намекает, что тот уже нашел себе новых друзей, которые заняли место Рику, и Соре он больше не нужен. Колдунья зовет его с собой, и Рику соглашается.

Леон и остальные рассказывают Соре, что их мир был уничтожен, а правителем этого мира был Энсем. Он был хорошим человеком, и отчеты, которые он писал, могут помочь делу. Леон также предупреждает Сору о Злой Колдунье. Сора с друзьями продолжают исследовать все новые миры, которые теперь открыты для них благодаря усовершенствованию Корабля Гамми.

После того, как Сора покидает Аграбу, мы видим, что Рику уже в комнате с Диснеевскими Злодеями. Он даже помог похитить одну из принцесс - Жасмин! За это, его желание исполняется - он видит, что Кайри лежит где-то без сознания, и он бросается ей на помощь. На самом деле, прекрасно видно, что это лишь еще одно глупое состязание, которое он сам устроил - он хочет найти Кайри первым, лишь чтобы доказать Соре, что он лучший.

Сора и Рику снова встречаются, на этот раз в мире Монстро - гигантского кита, где Рику хватает Пиноккио и убегает. Он дерзко заявляет, что нашел Кайри, и Сора бросается за ним. Но перед тем, как Сора настигает Рику, Колдунья появляется перед Рику и рассказывает ему о Тьме в его сердце. Она спрашивает его, с какой стати он так печется о Соре. Рику отвечает, что его с Сорой абсолютно ничего не связывает. Прекрасно видно, что он лжет. Колдунья исчезает, и прибегает Сора. Он очень разозлен поведением Рику, но им обоим приходится ненадолго встать на одну сторону, чтобы спасти Пиноккио от огромного Бессердечного.

Пиноккио на свободе, но Рику снова хватает его, и говорит, что использует деревянного малыша, чтобы спасти Кайри. Он предлагает Соре встать на свою сторону, во имя спасения Кайри. Сора отказывается, и уже, было, хочет напасть на Рику, но огромное чудовище возвращается, и на этот раз, Соре приходится биться с ним в одиночку. Рику же бесследно исчезает.

Секунду спустя, мы видим Рику, склонившегося над бездыханным телом Кайри. Он шепчет ей, что это ненадолго, и с ней скоро все будет в порядке. Мы узнаем, наконец, зачем Злодеи похищали девушек - Семеро принцесс - ключ ко всем мирам. Рику обретает способность управлять Бессердечными, и теперь, найдя Кайри, он теряет всякий интерес к Соре.

Сора продолжает свое путешествие, сражаясь с Бессердечными, и запирая Замочные Скважины, пока снова не встречает Рику, на этот раз - на корабле Капитана Крюка. Сора видит, что у Рику в руках Кайри, которой, очевидно, очень плохо. У него просто в голове не укладывается, как его лучший друг мог совершить такую ужасную вещь, да еще и встал на сторону Бессердечных. Рику отвечает ему лишь ухмылкой, и, заперев Сору в трюме, приказывает Крюку не подпускать его к Кари, пока корабль не причалит к берегу.

Рику убежден, что он, непобедим, ведь ему удалось не только первым найти Кайри, он обладает властью над Бессердечными! Он совершенно изменился, и уже совсем не тот романтичный парень, каким мы помним его на острове. Им движет злость и желание первенства, тогда как Сора даже сейчас не обращает внимания на подлые поступки друга, и лишь волнуется о благополучии Кайри. Когда Рику снова заходит в трюм, Сора умоляет его прекратить, но тот исчезает, оставив ему лишь Бессердечную копию самого себя, с которым Соре приходится сражаться.

Выбравшись из мира Нет-и-не-будет, Сора преследует Рику до Бастиона Отчаянья. Оказывается, что Рику ранил Чудовище, а когда Сора пытается вступить с ним в бой, он забирает себе Ключ-клинок, с издевкой бросив ему на замену деревянный меч, с которым тот любил играть на острове, и оставляет его вместе с Чудовищем. Как ни поразительно, оказывается, что Мастер Ключ-клинка не один… Гуфи и Дональду тоже приходится идти с Рику, ведь они, по приказу Короля, должны следовать за Ключ-клинком. Сора, в отчаянии, и не зная, что делать, все же продолжает искать Кайри, бок о бок с Чудовищем. Позже, когда он снова встречает Рику, Гуфи и Дональд возвращаются к нему, и они, все вместе, сражаются с Рику. Побежденный, тот убегает. Ему являются люди в черных плащах, которых мы видели в пещере на Островах Судьбы, и один из них предлагает Рику куда большую мощь. В своем яростном стремлении, отомстить Соре, он соглашается.

Сора, победив Злую Колдунью, наконец-то находит Кайри. Рику, видя, что у Колдуньи силы на исходе, предлагает ей помощь. Когда Сора, Гуфи и Дональд видят Рику, они с удивлением замечают перемену в его голосе и новое оружие у него в руках. Темный Клинок призван «открывать» сердца людей, и Рику, чтобы доказать это, вонзает свое оружие прямо в грудь Колдуньи! Он выпускает на свободу «Истинную Тьму», что таилась в ее сердце, и Злая Колдунья преображается, обретая форму свирепого дракона.

После победы над драконом, Сора требует Рику вернуть Кайри ее сердце, но Рику открывает ему правду - Сердце Кайри… внутри Соры!! Ну конечно, в ту ночь на Острове, когда Кайри исчезла, пролетев сквозь Сору, ее сердце было в опасности, и потому, чтобы не потерять его, она заключило свое сердце внутри него. Мы узнаем, что Кайри - последняя Принцесса, и без нее невозможно открыть Замочную Скважину Бастиона Отчаянья. Рику, тем временем, открывает свое истинное лицо. Оказывается, что это… Энсем!! Сора поражен до глубины души. И тот самый человек в черной робе, что шептал ему в Секретной Пещере на острове, это и есть он. Рику пытается освободить сердце Кайри из груди Соры с помощью Темного Клинка, но в грянувшей битве он проигрывает, и бежит, оставив свое оружие. Сора поднимает Клинок, и принимает отчаянное решение - он вонзает его себе в грудь! Он сам падает наземь, а Кайри тотчас оживает. Она хочет подхватить его на руки, но не успевает - Сора исчезает. Темный Клинок преобразуется в шесть сердец остальных Принцесс.

Замочная Скважина открыта, и Бессердечные заполоняют Бастион. Появляется Энсем, несказанно обрадованный тем, что последняя Принцесса наконец-то пробудилась. Энсем хочет призвать Рику, чтобы расправиться с Гуфи и Дональдом, но тот отказывается. Рику кричит Кайри, чтобы та убегала, пока не поздно. Дональд и Гуфи силой выводят упирающуюся Кайри из комнаты, ведь там Сора и Рику! Что же с ними будет? За троицей увязывается какой-то Бессердечный, и вдруг они понимают - это же Сора! Кайри Крепко обнимает его, и Сора возвращается в нормальное состояние, после чего все они вчетвером спасаются бегством из Бастиона, кишащего Бессердечными.

Сора, Кайри и Гуфи с Дональдом возвращаются в Перекрестный Город, где Сора рассказывает Кайри, как же все было - сквозь тьму, он слышал ее голос, и следуя за ним, он спасся. Сора добавляет, что ему нужно идти, а Кайри придется остаться. Та говорит, что больше не боится за Рику - он сам сможет за себя постоять.

Сора, вопреки воплям Сида, собирается Запереть Замочную Скважину, чтобы предотвратить бесконечный поток Бессердечных во все миры. В Бастионе, он говорит со всеми Принцессами. Напоследок, Сору встречают Леон, Айрис, Юффи и Сид, которые рассказывают ему, что как только он одержит победу над Энсемом, миры восстановятся в своем первозданном виде, а с ними - и их границы, неприступные для Корабля Гамми. Другими словами, они могут никогда больше не увидеться. Хотя расставаться с друзьями Соре вовсе не по нутру, он все же решается сделать так, как будет лучше для всех - он запирает Замочную Скважину.

Напоследок, еще раз выслушав советы всех Принцесс, сора отправляется в «Конец Света». Этот мир собран из обрывков всех миров, уничтоженных Бессердечными. Сора беспокоится, что же с ними станет, когда Энсем будет повержен… Но Гуфи твердо уверен - их сердца никуда не денутся. Оказавшись в месте, похожем на Острова Судьбы, Сора видит Рику, который, при попытке заговорить с ним, обращается в Энсема. Он говорит, что Рику не слышит Сору - его сердце очень-очень далеко. Он продолжает разглагольствовать на тему того, что Тьма всегда побеждает Свет, и, наконец, Сора вступает с ним в последнюю битву. Сражение проходит во множестве мест, и Энсем все время меняет формы, но, в конце концов, Сора ослабляет его. Тот все еще предан Тьме, и говорит, что Ключ-клинок бессилен против ее могущества. Он просит Королевство Сердец, сердце всех миров, исполнить его Тьмы. Сора отвечает, что Королевство Сердец есть Свет. Дверь открывается, и ослепляющий свет уничтожает Энсема.

Сора, Дональд и Гуфи стремглав бросаются к двери к Королевству Сердец, чтобы запереть ее, но с удивлением видят, что за дверью полным-полно Бессердечных. Что же это значит?! Неужели это все-таки Дверь во Тьму? По ту сторону двери - сам Король Микки, и Рику помогают Соре закрыть дверь. Оказывается, что у Микки тоже есть Ключ-клинок. Два Ключ-клинка, с обоих сторон запирают Дверь. Но это значит, что Рику и Королю придется остаться по ту сторону.

Миры начинают восстанавливаться, и Кайри попадает на Острова Судьбы, а Сора должен остаться здесь. Он обещает Кайри, что обязательно вернется к ней, и между ними разверзается водопад звезд. Кайри, со слезами на глазах, медленно удаляется, а Сора машет ей вслед. Тот факт, что Сора не смог вернуться на родные острова может означать только одно - его путешествие еще не закончилось. Ему все еще предстоит найти Рику и Короля Микки.

Сора, Дональд и Гуфи идут по красивому полю, и размышляют что же делать дальше, как вдруг мимо пробегает Плуто с письмом, тесненным Королевской Печатью в зубах. Друзья радостно бегут за ним. Таинственный голос говорит, что Сора должен открыть Дверь к Свету. Что же было дальше, вы узнаете, поиграв в Kingdom Hearts: Chain of Memories и Kingdom Hearts 2.